ヘルステック DockerでJupyter notebookを使う方法 【たった1行で起動できる】 バイオデータ解析になくてはならないJupyterNotebookを、Dockerから起動する方法をまとめています。面倒な環境構築は不要で、1行で使うことができます... H Shimizu
ヘルステック がんの体細胞変異 (somatic mutation) を解釈する 【リソースを紹介】 がんの変異遺伝子を解釈するウェブツールをまとめました。プログラミングができなくても、ブラウザから簡単に調べることができます。... H Shimizu
ヘルステック PythonのSymPyで微分方程式を解く方法 【ロトカヴォルテラを題材に】 SymPyを使えば簡単に数式展開もできます。この記事では、SymPyで微分方程式を解く方法を、数理生物学の基本の1つであるロトカヴォルテラ方程式を題材にコード付きで紹介します。... H Shimizu
ヘルステック 生活習慣病と遺伝子型のデータ 【Metabolic Disease Portalの紹介】 メタボロームに関係する疾患は、生活習慣の変化もあって世界的に増えています。この記事では、遺伝子型とメタボローム関連病の関係についてのデータベースを紹介します。... H Shimizu
ヘルステック Rによるヒートマップの作り方 【遺伝子クラスタリング・色の変更も】 生命科学・医学研究ではヒートマップを書くことは少なくありません。この記事では、Rを使ってヒートマップを書く実際の手順を紹介します。... H Shimizu
ヘルステック NGS生データの登録方法の概要 【DDBJの例】 論文を投稿するときには、そのデータを公共データベースに登録することが要求されます。この記事ではDDBJ-DRAにfastqファイルを登録する方法の概要について紹介します。... H Shimizu
ヘルステック ColabとGoogle Drive、GCSの読み込み法 【手順を解説】 この記事では、Google Colabをハブにして、Googleが運営する他のサービス、具体的にはGoogle Cloud Storage (GCS)とGoogle Driveの連携について紹介します。... H Shimizu
ヘルステック 細胞周期をシミュレーションする 【CellDesigner使い方入門】 この記事では、細胞周期がいかにロバストかを、CellDesignerというソフトを使って実際にシミュレーションして確かめてみます。... H Shimizu
ヘルステック iDEPによるwebベースのRNA-seq解析【初心者でも安心】 RNA-seq解析は今や多くの生命科学研究に取り入れられています。このデータ解析を手助けしてくれるwebツール, iDEPについて紹介します。... H Shimizu
ヘルステック 対話型AIによる次世代のがんオミクス解析 【DrBioRightの登場】 これまで多数のバイオインフォマティクスツールが開発されてきましたが、ついに対話型AIによるがん解析ツールDrBioRightが登場しました。この記事ではDrBioRightについて紹介します。... H Shimizu
ヘルステック HTAN: Human Tumor Atlas Network 【2020年代の国際がんプロジェクト】 がんに関する国際的なプロジェクトはこれまでいくつか行われてきましたが、今あたらしいプロジェクトが始動しています。この記事ではHuman Tumor Atlas Networkプロジェクトについて紹介します。... H Shimizu
ヘルステック 初期研修医にオススメのスマホアプリ 【若手医師にも便利】 医療の知識は膨大であり、必要に応じて調べていく必要があります。この記事では、主に研修医の先生が入れておくと便利なスマホアプリを紹介しています。... H Shimizu
