ヘルステック Graph convolutionを数式を使わずに解説 【グラフ畳み込みのPythonコード】 生命医学や創薬研究にも使われるようになってきているグラフ畳み込みニューラルネットワーク(GCN)について、この記事では数式を使わないで北韓的に理解できるように解説しています。... Web master
ヘルステック スマートデバイスで生活習慣病を防ぐ 【スマートウォッチと体組成計】 少し前までは自分の睡眠や運動を客観的にみることは難しかったのですが、最近は「健康的な」生活を後押ししてくれるスマートデバイスがいろいろ増えてきました。この記事では生活習慣病になりにくい体質をつくるのに役立つスマートデバイスの今を紹介します。... Web master
ヘルステック Biopython入門 - 中編 【NCBIデータベースやBlastへのアクセス】 BiopythonはPythonをベースにした生命科学研究のためのパッケージで、その基礎的な使い方を3回に渡って紹介しています。2回目になる今回は、NCBIの代表的なツールであるEntrezデータベースとBlast検索をBiopythonで行う方法を見ていきます。... Web master
ヘルステック Biopython入門 - 前編 【インストール ~ 簡単な使い方】 Biopythonは生命科学研究に特化したPythonのパッケージであり、さまざまな情報解析をサポートすることができます。この記事ではBiopythonの基本的な使い方を解説します。... Web master
ヘルステック DBSCANクラスタリングをPythonで行う方法 【scikit-learnによる実装コードあり】 DBSCANは非常に強力なクラスタリングアルゴリズムです。この記事では、DBSCANをPythonで行う方法をプログラムコード付きで紹介し、DBSCANの長所と短所をデータサイエンスを勉強中の方に向けて解説します。... Web master
ヘルステック UCSC Xenaの使い方 【がんデータ解析をウェブブラウザのみで行えるツール】 TCGAは有名な国際がんプロジェクトですが、そのTCGAデータに特別なプログラミング能力がなくてもアクセスできるようにしてくれるツールがUCSC Xenaです。この記事では、Xenaの使い方を図解で説明します。... Web master
ヘルステック GWASデータの探し方 【遺伝子型と表現型の関係を解き明かす】 遺伝型と疾患とのつながりを研究するGWASで見つかった疾患関連SNPの探し方や解析に使える便利なツールを紹介しています。... Web master
ヘルステック 人工知能を使った製薬支援【創薬インフォマティクス】 ハイスループットスクリーニングなどの新しい実験技術の出現により、化合物の活性や生物医学的データが著しく増加しています。そのデータを人工知能で解析することで創薬に結びつけようという研究のトレンドについてまとめます。... Web master
ヘルステック 大衆化するシングルセルRNA-seq解析パイプライン 【新しい技術の台頭も】 シングルセルRNA-seq解析の解析は比較的簡単にできるようになってきました。この記事では大衆化するシングルセルRNA-seqパイプラインについてまとめます。... Web master
ヘルステック Rによる生存時間解析 【survivalパッケージでカプランマイヤー・コックス比例ハザード】 統計計算のフリーソフトRは、生命医学研究のさまざまなところで使われています。この記事では、Rを使った生存時間解析を紹介します。... Web master
ヘルステック がんゲノムのデータベースと解析ツール 【コマンド不要】 使いやすいウェブベースのツールがたくさん登場したことで、コマンドに馴染みがない方でも簡単にがんのデータ分析ができるようになりました。この記事では、ウェブで完結するがんデータベースとツールについて紹介します。... Web master
ヘルステック NumPyとPandasの意外と知らない10の関数 【コードあり】 NumPyとPandasはデータサイエンスを行う上で重要な役割を果たしています。これらがなければ今日のデータ分析は非常に困難になるといっても過言ではありません。この記事では、そんなNumPyとPandasをより便利に使うための機能を紹介します。... Web master