ヘルステック Rによる生存時間解析 【survivalパッケージでカプランマイヤー・コックス比例ハザード】 統計計算のフリーソフトRは、生命医学研究のさまざまなところで使われています。この記事では、Rを使った生存時間解析を紹介します。... H Shimizu
ヘルステック がんゲノムのデータベースと解析ツール 【コマンド不要】 使いやすいウェブベースのツールがたくさん登場したことで、コマンドに馴染みがない方でも簡単にがんのデータ分析ができるようになりました。この記事では、ウェブで完結するがんデータベースとツールについて紹介します。... H Shimizu
ヘルステック NumPyとPandasの意外と知らない10の関数 【コードあり】 NumPyとPandasはデータサイエンスを行う上で重要な役割を果たしています。これらがなければ今日のデータ分析は非常に困難になるといっても過言ではありません。この記事では、そんなNumPyとPandasをより便利に使うための機能を紹介します。... H Shimizu
ヘルステック エンリッチメント解析の基本 【GO解析とその注意点】 手元にある遺伝子リストにはどのような生命医学的な意味があるのかを調べる際に、手がかりとなるのがエンリッチメント解析です。この記事では、エンリッチメント解析の方法と注意点をまとめます。... H Shimizu
ヘルステック 匂いを識別する人工知能が開発される 人工知能 (AI) は匂いの存在を検知することができ、それだけではなくアンモニアや一酸化炭素などの匂いを識別することもできるという研究成果がNature Machine Intelligence誌に報告されました。... H Shimizu
ヘルステック 新型コロナウイルスのテクノロジーを使った対策 【予測・早期検出・治療】 2019年末に初めて報告された新型コロナウイルス2019-nCoV。SARSが流行した2003年には存在しなかった新しい技術が、新型コロナウイルスの管理や予防に役立つと期待されています。... H Shimizu
ヘルステック Rにおけるグラフの書き方入門【簡単なスクリプトコピペでOK】 この記事では、R Graphical Manualを使ったグラフの書き方について紹介します。Rについての専門的な技術がなくてもグラフを書くことができるツールEZRやBoxPlotRも合わせて紹介しています。... H Shimizu
ヘルステック 大規模画像データ解析に使うソフト 【ImageJとそのプラグインを中心に】 生命科学・医学においては、CTやMRI、手術標本の病理 (顕微鏡) 画像、あるいは近年話題になっている臓器を透明化して超解像顕微鏡で生命現象を探求する方法などで、とても大きな画像データがたくさん得られます。この記事では、そういった大画像データを処理するのに使えるツールをまとめました。... H Shimizu
ヘルステック シングルセル解析に使うR/Bioconductorパッケージ 【入門編】 1細胞解析は、生命科学研究にとってますます重要になりつつあります。この記事では、1細胞解析に使われるBioconductorパッケージについて紹介します。... H Shimizu
ヘルステック エンハンサー解析に使えるデータベース 【ウェブツール7つ】 遺伝子の発現量を調節する要素はプロモーターだけでなくヒストン修飾などのエピジェネティクスを含めた様々ありますが、その1つにエンハンサーが含まれています。この記事では、エンハンサーに取り組む生命科学系の学生さんに向けて無料で使える代表的なデータベースを紹介します。... H Shimizu
ヘルステック Google Colaboratoryでデータサイエンスを始めよう【使い方入門】 Googleが運営する、無料のPython環境がGoogle Colaboratoryで、データサイエンス・機械学習だけでなく生命科学研究の現場でも広く使われています。この記事では、Google Colaboratoryの入門的な使い方を解説します。... H Shimizu
ヘルステック タンパク質の代表的なデータベース7つ【まずはここから】 この記事では、普段あまりコンピューター解析に馴染みがない方に向けて、マウスクリックで操作できる代表的なタンパク質データベースをまとめました。... H Shimizu