ヘルステック

少し前までは自分の睡眠や運動を客観的にみることは難しかったのですが、最近は「健康的な」生活を後押ししてくれるスマートデバイスがいろいろ増えてきました。この記事では生活習慣病になりにくい体質をつくるのに役立つスマートデバイスの今を紹介します。...

BiopythonはPythonをベースにした生命科学研究のためのパッケージで、その基礎的な使い方を3回に渡って紹介しています。2回目になる今回は、NCBIの代表的なツールであるEntrezデータベースとBlast検索をBiopythonで行う方法を見ていきます。...

Biopythonは生命科学研究に特化したPythonのパッケージであり、さまざまな情報解析をサポートすることができます。この記事ではBiopythonの基本的な使い方を解説します。...

DBSCANは非常に強力なクラスタリングアルゴリズムです。この記事では、DBSCANをPythonで行う方法をプログラムコード付きで紹介し、DBSCANの長所と短所をデータサイエンスを勉強中の方に向けて解説します。...

TCGAは有名な国際がんプロジェクトですが、そのTCGAデータに特別なプログラミング能力がなくてもアクセスできるようにしてくれるツールがUCSC Xenaです。この記事では、Xenaの使い方を図解で説明します。...

遺伝型と疾患とのつながりを研究するGWASで見つかった疾患関連SNPの探し方や解析に使える便利なツールを紹介しています。...

ハイスループットスクリーニングなどの新しい実験技術の出現により、化合物の活性や生物医学的データが著しく増加しています。そのデータを人工知能で解析することで創薬に結びつけようという研究のトレンドについてまとめます。...

シングルセルRNA-seq解析の解析は比較的簡単にできるようになってきました。この記事では大衆化するシングルセルRNA-seqパイプラインについてまとめます。...

統計計算のフリーソフトRは、生命医学研究のさまざまなところで使われています。この記事では、Rを使った生存時間解析を紹介します。...

使いやすいウェブベースのツールがたくさん登場したことで、コマンドに馴染みがない方でも簡単にがんのデータ分析ができるようになりました。この記事では、ウェブで完結するがんデータベースとツールについて紹介します。...

NumPyとPandasはデータサイエンスを行う上で重要な役割を果たしています。これらがなければ今日のデータ分析は非常に困難になるといっても過言ではありません。この記事では、そんなNumPyとPandasをより便利に使うための機能を紹介します。...

手元にある遺伝子リストにはどのような生命医学的な意味があるのかを調べる際に、手がかりとなるのがエンリッチメント解析です。この記事では、エンリッチメント解析の方法と注意点をまとめます。...