生命科学 迅速アルカリミニプレップ法の原理とプロトコル 【フェノール不要】 プラスミドのコンストラクト構築とその抽出は生命科学研究の基本です。この記事ではプラスミド抽出の簡単な原理とプロトコル、注意点をまとめます。... Web master
ヘルステック 感染症のSIRモデル発展編 【数理モデルの拡張】 感染症の広がりをシミュレーションするSIRモデルには発展型があります。この記事では、もう少し複雑なモデルについてシミュレーションコードとともに紹介します。... Web master
ヘルステック 感染症のSIRモデル入門編 【シミュレーションコードあり】 感染症の広がり方を予測する代表的な数理モデルがSIRモデルです。この記事では、SIRモデルの基本を説明し、pythonによるシミュレーション例を示します。... Web master
生命科学 生命科学実験における再利用のススメ 【日常的なルーチン3つ】 研究の予算は限られています。この記事では、日常的によく行われている実験のうち、再利用して何回も使うことでゴミも研究費も減らせるアイデア3つを紹介します。... Web master
生命科学 ENCODE projectの概要 【ゲノム・遺伝子を解き明かす】 ENCODEは、2003年に開始した国際的なヒトゲノム解析プロジェクトで、ヒトゲノムのすべての機能要素の解析をめざしています。この記事では、フェーズIからIIIまでの概略についてまとめます。... Web master
ヘルステック 抗がん剤の感受性を予測する 【機械学習方法とリソース】 抗がん剤がどれくらい効くのか、を機械学習で予測する方法も開発されてきています。この記事では、そういった手法の概要やリソースについて紹介します。... Web master
キャリアパス 研究能力の評価指標10選 【研究者の戦闘力】 研究職のポジションや研究資金配分をめぐる競争に使用されるさまざまな研究能力指標があります。この記事では、インパクトファクターやh-indexだけではないさまざまな指標について紹介します。... Web master
ヘルステック Pythonでggplot2を使って可視化する 【plotnine入門】 Rにはデータの可視化をするためのライブラリーであるggplot2があり広く使われていますが、Pythonからでもggplot2が使えます。この記事ではplotnineというパッケージを紹介し、Pythonでggplot2を使う方法を紹介します。... Web master
生命科学 ヌクレアーゼの種類と基質 【分子生物学研究で使う】 ヌクレアーゼは核酸分解酵素の総称です。自然界にはさまざまなヌクレアーゼがありますが、特に分子生物学研究でよく使われているものは限られています。この記事では、実験でよく使われる代表的なヌクレアーゼについて紹介します。... Web master
ヘルステック PSI-BLASTでホモログ配列を検索する【PSSMやProfileの計算法も】 遠いホモログ配列を感度良く検出する方法がPSI-BLASTです。この記事では、PSI-BLASTの基盤となっているPSSMやProfileの計算法について簡単に紹介した後、実際にPSI-BLASTを使っていきます。... Web master
医学 薬物動態をシミュレーションする方法 【Rで簡単に計算できる】 薬物動態の適切なシミュレーションは、治療の基本です。この記事では統計ソフトRのlinpkパッケージを使って簡単に薬物動態をシミュレーションする方法について紹介します。... Web master
サイト運営情報 2020年7月 【アクセスランキング】 いつも当サイト、生命医学をハックするをご覧いただきありがとうございます。 7月は2万ちょっとアクセスがありました。この記事では、2020年7月にアクセス数が多かった人気記事をまとめます。 20位 ~ 11位 10位 ~ 1位... Web master
