感染症の広がりをシミュレーションするSIRモデルには発展型があります。この記事では、もう少し複雑なモデルについてシミュレーションコードとともに紹介します。...
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大学に勤める研究者 。専門は分子生物学とデータサイエンス。【略歴】医師免許取得後、研修医を経て大学院入学、博士号取得。アメリカでのポスドクを経て、現在は日本国内の大学教員をしている。
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Web masterの記事一覧
感染症の広がり方を予測する代表的な数理モデルがSIRモデルです。この記事では、SIRモデルの基本を説明し、pythonによるシミュレーション例を示します。...
研究の予算は限られています。この記事では、日常的によく行われている実験のうち、再利用して何回も使うことでゴミも研究費も減らせるアイデア3つを紹介します。...
ENCODEは、2003年に開始した国際的なヒトゲノム解析プロジェクトで、ヒトゲノムのすべての機能要素の解析をめざしています。この記事では、フェーズIからIIIまでの概略についてまとめます。...
抗がん剤がどれくらい効くのか、を機械学習で予測する方法も開発されてきています。この記事では、そういった手法の概要やリソースについて紹介します。...
研究職のポジションや研究資金配分をめぐる競争に使用されるさまざまな研究能力指標があります。この記事では、インパクトファクターやh-indexだけではないさまざまな指標について紹介します。...
Rにはデータの可視化をするためのライブラリーであるggplot2があり広く使われていますが、Pythonからでもggplot2が使えます。この記事ではplotnineというパッケージを紹介し、Pythonでggplot2を使う方法を紹介します。...
ヌクレアーゼは核酸分解酵素の総称です。自然界にはさまざまなヌクレアーゼがありますが、特に分子生物学研究でよく使われているものは限られています。この記事では、実験でよく使われる代表的なヌクレアーゼについて紹介します。...
遠いホモログ配列を感度良く検出する方法がPSI-BLASTです。この記事では、PSI-BLASTの基盤となっているPSSMやProfileの計算法について簡単に紹介した後、実際にPSI-BLASTを使っていきます。...
薬物動態の適切なシミュレーションは、治療の基本です。この記事では統計ソフトRのlinpkパッケージを使って簡単に薬物動態をシミュレーションする方法について紹介します。...
いつも当サイト、生命医学をハックするをご覧いただきありがとうございます。 7月は2万ちょっとアクセスがありました。この記事では、2020年7月にアクセス数が多かった人気記事をまとめます。 20位 ~ 11位 10位 ~ 1位...
ビッグデータや人工知能など、データサイエンスの重要性はますます高まっています。この記事では、データサイエンスの情報源になる、海外の良質なブログを紹介します。...