手元にある遺伝子リストにはどのような生命医学的な意味があるのかを調べる際に、手がかりとなるのがエンリッチメント解析です。この記事では、エンリッチメント解析の方法と注意点をまとめます。...
ヘルステック
医療に押し寄せるITやAI、ものづくりといった話題です。
ヘルステックの記事一覧
人工知能 (AI) は匂いの存在を検知することができ、それだけではなくアンモニアや一酸化炭素などの匂いを識別することもできるという研究成果がNature Machine Intelligence誌に報告されました。...
2019年末に初めて報告された新型コロナウイルス2019-nCoV。SARSが流行した2003年には存在しなかった新しい技術が、新型コロナウイルスの管理や予防に役立つと期待されています。...
この記事では、R Graphical Manualを使ったグラフの書き方について紹介します。Rについての専門的な技術がなくてもグラフを書くことができるツールEZRやBoxPlotRも合わせて紹介しています。...
生命科学・医学においては、CTやMRI、手術標本の病理 (顕微鏡) 画像、あるいは近年話題になっている臓器を透明化して超解像顕微鏡で生命現象を探求する方法などで、とても大きな画像データがたくさん得られます。この記事では、そういった大画像データを処理するのに使えるツールをまとめました。...
1細胞解析は、生命科学研究にとってますます重要になりつつあります。この記事では、1細胞解析に使われるBioconductorパッケージについて紹介します。...
遺伝子の発現量を調節する要素はプロモーターだけでなくヒストン修飾などのエピジェネティクスを含めた様々ありますが、その1つにエンハンサーが含まれています。この記事では、エンハンサーに取り組む生命科学系の学生さんに向けて無料で使える代表的なデータベースを紹介します。...
Googleが運営する、無料のPython環境がGoogle Colaboratoryで、データサイエンス・機械学習だけでなく生命科学研究の現場でも広く使われています。この記事では、Google Colaboratoryの入門的な使い方を解説します。...
この記事では、普段あまりコンピューター解析に馴染みがない方に向けて、マウスクリックで操作できる代表的なタンパク質データベースをまとめました。...
公共データを使ったChIP-on-chipの再解析の例として、この記事ではデータのダウンロードの方法から統計ソフトRを使った具体的なコードを紹介します。...
プラスミド作成は生命科学研究の基本手技の1つです。この記事では、そんなプラスミド管理に役立つツールを紹介します。...
ある塩基配列がゲノム中にあるのか、あるならばどこにあるのかを知りたいことは多々あります。この記事では、そんな時に役に立つウェブツールGGGenome (ゲゲゲノム) を紹介します。...