生命科学 ENCODE projectの概要 【ゲノム・遺伝子を解き明かす】 ENCODEは、2003年に開始した国際的なヒトゲノム解析プロジェクトで、ヒトゲノムのすべての機能要素の解析をめざしています。この記事では、フェーズIからIIIまでの概略についてまとめます。... Web master
ヘルステック 抗がん剤の感受性を予測する 【機械学習方法とリソース】 抗がん剤がどれくらい効くのか、を機械学習で予測する方法も開発されてきています。この記事では、そういった手法の概要やリソースについて紹介します。... Web master
キャリアパス 研究能力の評価指標10選 【研究者の戦闘力】 研究職のポジションや研究資金配分をめぐる競争に使用されるさまざまな研究能力指標があります。この記事では、インパクトファクターやh-indexだけではないさまざまな指標について紹介します。... Web master
ヘルステック Pythonでggplot2を使って可視化する 【plotnine入門】 Rにはデータの可視化をするためのライブラリーであるggplot2があり広く使われていますが、Pythonからでもggplot2が使えます。この記事ではplotnineというパッケージを紹介し、Pythonでggplot2を使う方法を紹介します。... Web master
生命科学 ヌクレアーゼの種類と基質 【分子生物学研究で使う】 ヌクレアーゼは核酸分解酵素の総称です。自然界にはさまざまなヌクレアーゼがありますが、特に分子生物学研究でよく使われているものは限られています。この記事では、実験でよく使われる代表的なヌクレアーゼについて紹介します。... Web master
ヘルステック PSI-BLASTでホモログ配列を検索する【PSSMやProfileの計算法も】 遠いホモログ配列を感度良く検出する方法がPSI-BLASTです。この記事では、PSI-BLASTの基盤となっているPSSMやProfileの計算法について簡単に紹介した後、実際にPSI-BLASTを使っていきます。... Web master
医学 薬物動態をシミュレーションする方法 【Rで簡単に計算できる】 薬物動態の適切なシミュレーションは、治療の基本です。この記事では統計ソフトRのlinpkパッケージを使って簡単に薬物動態をシミュレーションする方法について紹介します。... Web master
ヘルステック 海外のデータサイエンスブログ10選 【最新情報・スキルを身につける】 ビッグデータや人工知能など、データサイエンスの重要性はますます高まっています。この記事では、データサイエンスの情報源になる、海外の良質なブログを紹介します。... Web master
生命科学 オートクレーブ滅菌と乾熱滅菌の使い方 【注意点とアルミホイルの意味も】 オートクレーブは生命科学実験でも医療器具にも広く使われている代表的な滅菌法です。この記事では、オートクレーブと乾熱滅菌のやり方や注意点についてまとめました。... Web master
ヘルステック SWISS-MODELの使い方 【タンパクホモロジーモデリング入門】 似たようなタンパク質の既知の構造を使って未知のタンパク立体構造を予測するホモロジーモデリングを行う代表的なツールSWISS-MODELを紹介します。 この記事ではSWISS-MODELの使い方を実際の解析例とともに紹介します。... Web master
医学 1コンパートメントモデルと消失速度定数 【簡単に薬物動態を計算する】 薬物がどれくらいの速度で血中から消失していくのかの大きな指標になるのが、消失速度定数と生物学的半減期です。この記事では、複雑な体内を非常に単純化したコンパートメントモデルを紹介し、生物学的半減期を計算する方法について見ていきます。... Web master
医学 分布容積と組織移行性を分かりやすく 【計算方法と小さい・大きいの目安】 薬が全身の臓器にどれくらい移行するのかを知る1つの指標が分布容積 (Vd)です。この記事では医療系の学生さんに向けて、実際の添付文書の例を挙げて分布容積の意味と組織移行性の目安を紹介します。... Web master
